Trong mười năm 1990-1999, Hội Hình thái học đã có nhiều hoạt động khoa học phong phú, góp phần phát triển các chuyên ngành hình thái học ở nước ta. Ngay từ ngày đầu thành lập (1968), nhất là những năm gần đây Hội đã xuất bản được đều đặn mỗi năm 2 số tập san Hình thái học. Hội cũng đã kết hợp với các bộ môn chuyên ngành tại các cơ sở đào tạo nhiều cán bộ chuyên ngành thuộc nhiều cấp học và nhiều người đã trở thành cán bộ khoa học chuyên khoa sâu của ngành.