Sinh thiết phổi xuyên phế quản qua ống nội soi phế quản quang học mềm là một thủ thuật khá an toàn, thích hợp để lấy bệnh phẩm giúp chẩn đoán giải phẫu bệnh hoặc vi trùng học trong những bệnh phổi có thâmm nhiễm nhu mô khu trú hoặc lan toả trên phim X quang phổi. Các tổn thương này gợi ý đến K phổi hoặc bệnh phổi mô kẽ do vi trùng, do rối loạn miễn dịch hay do thải ghép. Sinh thiết phổi xuyên phế quản không quá xâm lấn, biến chứng tuỳ thuộc vào tay nghề bác sỹ.