Nội soi đường tiêu hóa hiện được áp dụng trong chảy máu đường tiêu hóa trên gồm: chảy máu do vỡ tĩnh mạch thực quản giãn, chảy máu từ dạ dày tá tràng, chảy máu từ đường mật, nội soi thực quản. Nội soi dạ dày tá tràng: viêm niêm mạc dạ dày, loét dạ dày tá tràng, ung thư dạ dày, ung thư bóng vater. Nội soi hậu môn-trực tràng. Nội soi trực tràng-đại tràng.