Bệnh viêm khớp dạng thấp trẻ em cũng có đặc điểm giải phẫu bệnh giống viêm khớp dạng thấp người lớn là viêm bao hoạt dịch khớp mãn tính ăn mòn với hủy xương và tàn phế là hậu quả tất yếu. Điểm khác biệt là đa số trẻ có chức năng vận động khớp còn khá tốt, điều này không có nghĩa là ít nguy cơ tổn thương xương hơn người lớn vì hoạt tính viêm có xu hướng mạnh và lan tỏa hơn. Cơ chế bệnh sinh của bệnh cũng như kết quả nghiên cứu đều cho thấy hủy xương và phản ứng viêm cơ liên quan rất mật thiết. Vì vậy phải tích cực ngăn chặn phản ứng viêm cấp ngay lúc khởi phát. Bên cạnh xét nghiệm về phản ứng viêm cần phải chụp X-quang khớp thông thường để phát hiện tổn thương kín đáo. Bằng cách dùng hợp lý nhóm thuốc kháng viêm và thuốc chống thấp giúp hạn chế tàn phế cho trẻ do tổn thương xương.