Áp xe cơ tim là biến chứng rất hiếm gặp của viêm nội tâm mạc, lâm sàng thường không phát hiện được. Bệnh diễn biến cực kỳ nặng, có nhiều nguy cơ dẫn đến tử vong. Trong số 111 BN viêm mủ màng tim (VMMT) thì có 3 trường hợp áp xe cơ tim gây chảy máu (2,7%). 3 BN VMMT biến chứng áp xe cơ tim trong nghiên cứu đều là trẻ em từ 2-12 tuổi có thời gian bị bệnh kéo dài 3-4 tuần. 2 BN cấy mủ có TCV (+), 1 BN cấy máu có TCV (+). Áp xe cơ tim thường gặp những ổ nhỏ đường kính từ vài mm đến dưới 10mm. Có trường hợp lúc mổ phẫu thuật viên cũng không phát hiện được áp xe cơ tim. Xử trí áp xe trên bệnh nhân AMMT trên lâm sàng vô cùng khó vì bờ ổ áp xe là tổ chức hoại tử nhiễm khuẩn không thể khâu được, nếu có khâu rồi cũng bục, thời gian sau mổ thường dẫn đến chảy máu thứ phát.