Trong luyện tập khí công, ngoài luyện âm – dương, tinh – khí – thần, người ta còn nói tới vận khí đến các tạng phủ, kinh lạc và một số huyệt nhằm phục hồi và nâng cao chức năng của các bộ phận đó. Qua thuyết tạng phủ, kinh lạc chúng ta nhận thấy rằng: không có bộ phận nào, chức năng nào của cơ thể mà không được nói tới. Chỉ có điều cách nói, cách mô tả có khác so với y học hiện đại. Những cấu trúc – chức năng đó của tạng phủ, kinh lạc đến nay chúng ta vẫn còn chưa có những nghiên cứu y học nào làm sáng tỏ được hoàn toàn. Từ trong cơ sở lý luận cũng như các phương pháp chữa bệnh và phòng bệnh của y học cổ truyền, trong đó có phương pháp khí công, làm cho chúng ta nhận ra một điều cơ bản nhất là: sở dĩ cơ thể sống có các tạng phủ, các đường kinh và các huyệt với các chức năng khác nhau như vậy là bởi phần khí của chúng có những đặc trưng khác nhau. Khi cắt nghĩa được cái gọi là khí của y học cổ truyền chính là quá trình chuyển hóa, quá trình trao đổi chất và năng lượng của y sinh học hiện đại chúng ta càng tin tưởng rằng: “Khi luyện khí một cách công phu theo phương pháp khí công, chúng ta có thể điều chỉnh, điều khiển, thậm chí còn làm thay đổi quá trình chuyển hóa tại các tạng phủ, kinh lạc và các huyệt theo ý muốn”.