Nhằm đảm bảo cho các kết quả xét nghiệm đều đạt tiêu chuẩn chất lượng quốc tế, một hệ thống kiểm soát chất lượng theo phương pháp của Australia đã được thiết lập tại phòng xét nghiệm Bệnh viện Quốc tế Việt Nam. Hệ thống kiểm soát này gồm hai nội dung: hệ thống nội kiểm chất lượng và hệ thống ngoại kiểm chất lượng. Các giá trị của mẫu kiểm chứng đều nằm trong giới hạn cho phép. Các kết quả của Bệnh viện Quốc tế đều nằm trong giới hạn cho phép. Các giá trị SD, CV có độ chính xác cao khi so sánh với các phòng xét nghiệm khác trên thế giới tham gia chương trình.