10296 bệnh nhi dưới 5 tuổi bị tiêu chảy vào điều trị tại 6 bệnh viện lớn ở cả 2 miền Bắc và Nam. Kết quả: tỷ lệ mắc tiêu chảy do virus rota tại ca bệnh viện không có sự chênh lệch nhiều, từ 49,84%- 56,12%. Nhóm tuổi mắc tiêu chảy do virus rota với tỷ lệ cao từ 3-35 tháng tuổi, trong đó nhóm tuổi từ 6-17 tháng có tỷ lệ mắc cao nhất. Tỷ lệ mắc cao tiêu chảy do virus rota ở miền Bắc vào các tháng mùa đông và xuân, mùa hè và thu giảm rõ rệt. Miền Nam bệnh xuất hiện quanh năm với tỷ lệ cao và ít biến đổi theo mùa. Kiểu gen phổ biến nhất: năm 1998-2000 là G2, năm 2000-2001 là G1 và năm 2001-2002 là G9.