Chẩn đoán lâm sàng bệnh virut đường thở cấp tính chủ yếu dựa vào: yếu tố dịch tễ và mùa, hội chứng nhiễm khuẩn nhiễm độc cấp (sốt, đau đầu, mặt đỏ, chóng mặt, mệt mỏi, đau mỏi các bắp cơ, đau cột sống thắt lưng), hội chứng viêm long đường hô hấp trên và dưới kèm theo viêm kết mạc mắt (hắt hơi, sổ mũi, chảy nước mũi, họng rát đỏ, viêm thanh quản, khí quản và viêm phế quản). Phân tích các triệu chứng lâm sàng để mở rộng chẩn đoán xác định cúm, á cúm, bệnh virut hợp bào đường thở, Rhinoviruses, Adenoviruses, Enteroviruses. Sau khi chẩn đoán xác định bệnh virut đường thở cấp, nên làm thêm 2 xét nghiệm: chiếu X quang phổi và xét nghiệm công thức máu.