Thực trạng vệ sinh trường học tại 89 trường được thanh kiểm tra trong năm học 1999-2000 và kết quả khảo sát kiến thức vệ sinh phòng bệnh tại 26 trường tiêu học và trung học cơ sở đã cho thấy tình hình vệ sinh môi trường học tập còn có nhiều vấn đề quan tâm: 50,56% số trường đủ diện tích khu trường, 47,19% số trường đủ diện tích cây xanh, 31,46% đủ diện tích sân chơi. Về vệ sinh lớp học cũng còn nhiều hạn chế 48,31% số trường đủ ánh sáng phòng học, 59,55% trường có bàn ghế đúng qui cách, 74,6% bảng học đạt yêu cầu. Các công trình vệ sinh trong nhà trường còn thiếu nhiều, 46,08% trường đủ hố xí, 64,04% trường đủ hố tiểu, 40,45% trường đủ nước uống cho học sinh.