Tháng 5 năm 2000 Trung tâm Y tế dự phòng Thừa Thiên Huế đã điều tra tình hình vệ sinh môi trường sau lũ lụt tại 30 cụm ngẫu nhiên. Tình trạng hố xí bị hư hỏng là 55,5%, giếng nước bị hư hỏng là 42,95%. Chất lượng nước qua xét nghiệm, tỷ lệ mẫu đạt đối với giếng khơi là 27,1% (vi sinh vật) và 42,4% (hóa học), giếng khoan 41,7% (vi sinh vật) và 16,7% (hóa học).