Các nghiên cứu dịch tễ học phân tử nhiễm HIV-1 tại Việt Nam cho thấy, HIV-1 thứ-typ tái tổ hợp CRF01 A/E (thứ-typ E theo phân loại cũ) vẫn là thứ-typ virut lưu hành chủ yếu tại Việt nam trong cả hai nhóm người lây qua tiêm chích ma túy và lây qua đường tình dục. Tuy nhiên sự hiện diện của các thứ-typ B, C và các virut tái tổ hợp khác cho thấy tình hình nhiễm virut HIV ở Việt Nam ngày càng phức tạp với sự du nhập các thứ-typ di truyền khác nhau và các virut tái tổ hợp khác.