Nghiên cứu 37 bệnh nhân viêm não Nhật bản năm 2004 tại Thanh Hóa cho thấy: Bệnh gặp chủ yếu ở lứa tuổi < 15, tỷ lệ mắc cao nhất ở nhóm tuổi 5 - 9 (51,4%). Vùng đồng bằng chiếm tỷ lệ cao nhất ( 48,6%), miền núi (32,4%), ven biển (19,0%). Bệnh xảy ra theo mùa tập trung từ tháng 4 đến tháng 9. Số bệnh nhân được tiêm 2 mũi vacxin phòng bệnh chiếm tỷ lệ thấp 2,7%. Các triệu chứng lâm sàng gặp cao nhất là: sốt (94,6%), rối loạn ý thức (94,6%), co giật (89,2%), cứng gáy (89,2%), tăng tiết đờm dãi (45,9%), dấu hiệu Kernig ( 56,8%).