Tỷ lệ nhiễm trùng sản phẩm (291/6382 mẫu) của Viện vacxin trong 11 năm qua là rất thấp chỉ 0,45% và giảm rõ rệt trong 3 năm gần đây (từ 2000 - 2003). Trong các vi sinh vật gây nhiễm thì chủ yếu là trực khuẩn gram dương chiếm 60% (195/320. Có 4,6% số mẫu nhiễm bào từ nấm mốc (15/320) tuy thấp song là điều đáng lo ngại cần loại trừ triệt để trong sản phẩm hoặc trong phòng kiểm tra vô trùng.