Trong số các nhóm bệnh truyền nhiễm ở 17 tỉnh thành phố khu vực phía Nam năm 1990 - 1994, đáng lưu ý đến tỷ lệ mắc một số bệnh đường ruột: thương hàn, lỵ, tiêu chảy, đang có xu hướng gia tăng mạnh mẽ, tiêu chảy 807,74/100.000 dân và thương hàn 81,30/100.000 dân. Các bệnh được tiêm chủng tỷ lệ mắc có xu hướng giảm ổn định. Bệnh do vectơ truyền đáng lưu ý về sốt xuất huyết có tỷ lệ mắc cao, cao nhất 246,73/100.000 dân năm 1992, 117,10/100.000 dân năm 1994. Rất đáng lưu ý về nhiễm HIV/AIDS trong khu vực, năm 1990 có 1 trường hợp mắc HIV, năm 1994 có 1.041 trường hợp mắc HIV và 53 trường hợp tử vong do AIDS.