Đến hết năm 1997 ở nước ta có 41/61 (67%) tỉnh thành quản lý y tế theo ngành và 18/61 (29,5%) quản lý theo lãnh thổ. Các nước ASEAN quản lý y tế theo ngành và ở nước ta một số ngành cũng quản lý theo ngành. Nghiên cứu và thực tiễn cũng như qua lấy ý kiến của các đơn vị chức năng về quản lý y tế cho thấy quản lý theo ngành là phù hợp. Khai thác được tiềm năng của các nguồn lực và phát huy được hiệu quả công tác y tế trong giai đoạn vừa qua và hiện nay.