Đặt vấn đề: Escherichia coli (E.coli) là vi khuẩn sống cộng sinh ở đại tràng, có các chủng gây bệnh và không gây bệnh. Trong số các gen độc lực của E.coli, gen afa là một gen quan trọng nhất chứng tỏ vi khuẩn có khả năng gây bệnh ở ngoài đường tiêu hóa. Mục tiêu: Xác định tỷ lệ E.coli gây nhiễm trùng ngoại khoa; Xác định tỷ lệ mang gen afa của E.coli trong một số nhiễm trùng ngoại khoa. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu 129 chủng E.coli phân lập từ các bệnh phẩm của 586 bệnh nhân bị nhiễm trùng ngoại khoa đang điều trị tại Bệnh viện Việt Đức và Bệnh viện 103 bằng kỹ thuật PCR. Kết quả: Trong nhiễm trùng ngoại khoa, căn nguyên do vi khuẩn E.coli chiếm tỷ lệ 22,01%. Trong số 129 chủng E.coli gây nhiễm trùng ngoại khoa, có 80 chủng mang gen afa (chiếm 62%), chủ yếu là nhiễm trùng mật và nước tiểu, không có chủng nào mang gen tiêu chảy. Tỷ lệ mang gen afa của E.coli phân lập được cao nhất ở bệnh phẩm dịch ổ bụng (100%), dịch mật (88,6%), máu (62,5%), nước tiểu (34,5%). Kết luận: Tỷ lệ mang gen afa của E.coli trong nhiễm trùng ngoại khoa cao, trong đó chủ yếu là nhiễm trùng mật và nước tiểu.