Được sự đầu tư, chỉ đạo của Bộ y tế và Dự án Quốc gia phòng chống sốt rét, Viện sốt rét - KST - CT TƯ, cũng như sự cố gắng vượt bậc của địa phương, nên từ năm 1998 đến 10 tháng đầu năm 2003, sốt rét đã ổn định ở Hà Giang. Hà Giang đạt 3 mục tiêu phòng chống sốt rét: mắc sốt rét giảm, không có người chết do sốt rét, không có dịch sốt rét. Có được kết quả đó do hàng năm Hà Giang đã thực hiện tốt kế hoạch phòng chống sốt rét và tăng cường công tác giám sát dịch tễ SR. Mười tháng đầu năm 2003, Hà Giang đã phát hiện sớm và giải quyết kịp thời một số xã có KST gia tăng, giữ cho SR ổn định.