Nội soi niệu quản ngược dòng được sử dụng chủ yếu khi sỏi nằm ở 1/3 dưới niệu quản, sỏi không cản quang, sỏi cystin, sỏi ở những bn đã điều trị ESWL không có kết quả. Để tán sỏi niệu quản bằng nội soi ngược dòng, người ta có thể sử dụng sóng thuỷ điện lực, sóng siêu âm, Lithoclast, laser. Phần lớn bn được gây tê tuỷ sống, ngoài ra có thể gây mê toàn thân hoặc gây mê tĩnh mạch. Đây là phương pháp điều trị sỏi nhanh hiệu quả tương đối an toàn.