Một trong những quan điểm có giá trị của bộ sách là quan điểm về con người, về mối quan hệ giữa con người và giới tự nhiên. Về con người, Lê Hữu Trác kế thừa tư tưởng triết học duy vật của Nho giáo coi con người là sản phẩm của quy luật tự nhiên, của thứ khí tinh túy nhất của trời đất. Ông quan niệm con người là hình ảnh thu nhỏ lại của giới tự nhiên. Sự biến hóa của tự nhiên sở dĩ không làm cho con người sinh bệnh được chính là nhờ cơ năng sinh lý của nhân thể tùy theo sự biến hóa của bốn mùa. Trên cơ sở tư tưởng về sự hài hòa và đối lập giữa con người với tự nhiên, Ông đã vận dụng vào chẩn đoán y học. Lê hữu Trác đã vận dụng các quan điểm triết học để xây dựng có hiệu quả phần y học lý luận và Ông đã làm cho các vấn đề y học mà Ông đề cập tới thể hiện những kiến giải và các xử trí giàu tính sáng tạo, đó là những đóng góp có giá trị của Lê Hữu Trác vào kho tàng tri thức y học dân tộc.