Chẩn đoán nhiễm Penicillin marneffei dựa vào các dấu hiệu lâm sàng, xét nghiệm soi dưới kính hiển vi bệnh phẩm từ các mô và nuôi cấy phân lập nấm ở 24 BN nhiễm HIV tại Viện Y học Lâm sàng các bệnh Nhiệt đới từ 2000-2002. Kết quả: nhiễm Penicillin marneffei là một biểu hiện nhiễm trùng cơ hội thường gặp trện BN nhiễm HIV/AIDS. Triệu chứng đặc trưng của nấm Penicillin marneffei là tổn thương các nốt sẩn đỏ ngoài da, có hoại tử đen ở trung tâm. Các biểu hiện lâm sàng đi kèm thường là sốt (83%), hạch toàn thân (92%), sụt cân (87%), gan to... Hầu hết BN có suy giảm miễn dịch trầm trọng, tỷ lệ tế bào CD4<100/mm3.