Phần mềm DECODA cho phép phân loại các số liệu về sinh thái và đa dạng sinh học một cách nhanh chóng, thuận tiện. Phân loại vườn cây thuốc dựa trên điều kiện tự nhiên, kinh tế và xã hội của các vườn điều tra, 60 cây thuốc được chia thành 7 nhóm. Kết quả 72% số vườn có điều kiện thích hợp với việc trồng cây thuốc nên có số cây thuốc rất nhiều. Sau khi phân loại cây thuốc trồng trong vườn dựa vào điều kiện sinh thái, 110 loài cây thuốc được chia thành 6 nhóm. Những cây thuốc có nguồn gốc từ vườn và nơi khác thích nghi với độ ẩm trung bình, độ mùn ít, tỷ lệ che bóng không cao, mật độ cao. Những cây thuốc có nguồn gốc từ vườn Quốc gia Ba Vì thích nghi với đất có độ ẩm cao, độ sâu tầng mùn lớn và tỷ lệ che bóng nhiều