Hơn 10 năm đổi mới, với những thành tựu kinh tế, tình hình sức khỏe và bệnh tật của nhân dân được cải thiện, mô hình bệnh tật ở Việt Nam có biến đổi. Ngành dược phải vượt qua những thách thức do yếu kém về trình độ khoa học công nghệ, năng lực tài chính, năng lực quản lý và tình trạng rời rạc thiếu phối hợp, phải chuẩn bị tích cực, chủ động trong hoạt động sản xuất kinh doanh ngay từ năm 2000 với những suy nghĩ mới: 1. Tiếp tục ổn định và phát triển sản xuất kinh doanh, tăng doanh thu, tăng thị phần trong nước, từng bước phát triển thị trường ngoài nước, tăng hiệu quả và thực hiện tốt nghĩa vụ với ngân sách Nhà nước.2. Đẩy mạnh đầu tư phát triển, thực hiện CNH, HĐH ngành dược theo hướng ưu tiên vào công nghiệp bào chế theo tiêu chuẩn GMP, ISO 9000. 3. Doanh nghiệp đầu tư hơn nữa cho hoạt động khoa học. 4. Thực hiện tốt quy hoạch, đào tạo cán bộ công nhân viên, chăm lo tốt đời sống vật chất tinh thần người lao động và công tác thi đua khen thưởng. 5. Thực hiện Chỉ thị số 15 của TTg trong việc kiện toàn và nâng cao hiệu quả cuả các Tổng Cty Nhà nước, khẳng định vai trò quan trọng trong nền kinh tế quốc dân của các doanh nghiệp Nhà nước