Cà phê hiện nay được xem như thức uống giải khát thông thường nhưng các nghiên cứu thực nghiệm đã cho thấy dùng tới liều nhất định cà phê có thể gây quái thai cho súc vật thực nghiệm. Vì vậy cần tránh dùng cà phê hằng ngày với liều quá cao, nhất là đối với phụ nữ mang thai. Trong điều trị bệnh, cafein là một chất kích thích hệ thần kinh trung ương, đặc biệt là trung tâm giác quan ở vỏ não và tủy: nó tác dụng lên các trung tâm hô hấp, thần kinh phế vị và vận mạch. Vì có tác dụng lên hệ thần kinh trung ương nên cafein và nước giải khát chứa cafein làm cho tư duy sáng suốt, người thấy tỉnh táo, hết mệt mỏi. Tuy nhiên, dùng nhiều quá cafein có thể gây độc tính nhất định: gây mệt sau một thời gian bị kích thích, gây khó ngủ, run rẩy và có khi ảo giác và mê sảng.